Масс-спектрометрия находит патогены
Созданный исследователями из Лондона способ, в базе которого лежит весов-спектрометрия, разрешает экспрессно определять штаммы и виды бактериальных и грибковых патогенов. В медицине новая методика может употребляться для обнаружения зараз, угрожающих судьбы и здоровью больных, разрешая сберечь драгоценное время и подобрать самые эффективные антибиотики.
Простым методом идентификации патогенных микроорганизмов в клиниках есть бактериальный посев, что обязан проводиться в микробиологических лабораториях с соблюдением всех нужных условий, причем для получения окончательного результата культура обязана высеиваться в течение нескольких суток.
Сейчас были созданы способы, не требующие высеивания примера микроорганизмов в питательную среду – такое определение микроорганизмов произошло за счет того, что для разных видов а также разных штаммов микроорганизмов отмечается различие в первичной структуре 16S-РНК. Не смотря на то, что таковой анализ возможно совершить стремительнее, чем взять результаты бакпосева, он требует особой подготовки примера и, во многих случаях не имеет возможности дать однозначный итог.
Золтан Такац (Zoltan Takats) из Имперского Колледжа Лондона, создавший новый способ, отмечает, что альтернативой секвенированию генов может стать весов-спектрометрия.
Таковой вывод был сделан на базе получения липидных профилей разных последующего применения и микроорганизмов этих молекулярных «отпечатков пальцев» для идентификации разных видов.
Для проверки догадки исследователи из группы Такаца решили проанализировать микрооорганизмы, выросшие при разных условиях, посредством весов-спектрометрия стремительной испарительной ионизации [rapid evaporative ionization mass spectrometry (REIMS)]. Колонии разбираемых микроорганизмов отбирали посредством устройства, напоминающего несколько клещей.
Пропускание тока через устройство ведет к образованию аэрозольного облака летучих в этих условиях соединений, в основном представленное липидами, характерными для данной колонии микроорганизмов. На следующем этапе эти летучие вещества подаются в камеру весов-спектрометра для анализа.
Компьютерная программа разбирает зарегистрированные спектры и сравнивает их с известными липидными профилями, что разрешило исследователям удачно различить 28 видов бактерий и пять видов грибков Candida fungi. Идентификация удавалась независимо от того, какова была численность бактерий в колонии, и довольно часто проводилось с точностью 95%.
Целый процесс идентификации от отбора колония до завершения работы программы и получения результатов идентификации микроорганизмов проходит от трех до пяти секунд. Дабы выяснить возможность идентификации разных штаммов одной и той же бактерии исследователи проанализировали липидные профили семи штаммов Escherichia coli и поняли, что отличить один штамм от другого возможно с возможностью 90%.